2005/12/7に発売された『W-ZERO3ガイドブック』で、W-ZERO3で動作する定番ソフトウェアにEBPocketが取り上げられています。
http://www.ascii.co.jp/books/detail/4-7561/4-7561-4700-3.html
他にHTC Universal i-mate JASJARで動作しているという報告があるので、特に問題なくWindows Mobile 5.0で動作するようです。
WM5.0の開発環境はVisual Studio2005だけでなくeMbeddedVisual Tools4.0も含まれているので、もともと動く可能性が高いのですが、細かな非互換性があるようなので、実機の動作報告が出るまでは、不確定でした。HPやDELLからもWNM5.0の日本語版の機種の出荷が始まっていますが、問題なく使用できると思われます。